線粒體是細胞的“能量工廠”，在能量穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮重要的作用。線粒體DNA單堿基突變就可導(dǎo)致發(fā)育障礙、神經(jīng)肌肉疾病等多種疾病。開發(fā)針對線粒體DNA的基因編輯工具一直是線粒體遺傳學(xué)領(lǐng)域的長期目標。DdCBE線粒體堿基編輯器可針對雙鏈線粒體DNA，將C·G堿基對編輯為T·A堿基對，實現(xiàn)對線粒體的精準定向編輯。而，一個的潛在安全隱患是線粒體靶向信號的介導(dǎo)能否保證全部 DdCBE 定位在線粒體中，而不是部分泄露到細胞核，從而造成潛在的脫靶編輯。因此對核基因組脫靶效應(yīng)及工具本身的安全性評估是極為必要的。
2022年5月12日，北京大學(xué)伊成器團隊在Nature雜志發(fā)表了題為“Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations”的研究論文。該研究應(yīng)用了該團隊之前發(fā)表的Detect-seq技術(shù)，對DdCBE堿基編輯工具在人類細胞中核基因組脫靶編輯進行了無偏向性地評估，并探索了相關(guān)機制，發(fā)現(xiàn)了TAS依賴型和TAS非依賴型的脫靶；并意外發(fā)現(xiàn)由細菌毒素 DddA 構(gòu)成的 DdCBE 堿基編輯工具與維持細胞三維結(jié)構(gòu)的重要蛋白 CTCF有相互作用。本研究對DdCBE堿基編輯工具在基礎(chǔ)研究和疾病治療中的應(yīng)用具有重要的意義。
優(yōu)質(zhì)的試劑是科學(xué)研究的利器。該團隊在細胞培養(yǎng)的過程中，使用全式金TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit對支原體檢測，確保細胞無支原體污染；在基因克隆實驗中使用TransStart? FastPfu DNA Polymerase進行PCR 片段擴增，并將成功構(gòu)建的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入Trans1-T1 Phage Resistant化學(xué)感受態(tài)細胞。
TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit（FM311）
一款高效的PCR法支原體檢測試劑盒，特異性擴增支原體DNA。因操作簡便、快速（2小時內(nèi)即可出結(jié)果）、特異性強、靈敏度高的特點備受客戶喜愛，多次榮登Nature期刊。
產(chǎn)品特點：
· 靈敏度高，可檢測低至20個拷貝的支原體。
· 特異性強，只擴增支原體DNA，真核細胞和細菌DNA不被擴增。
· 操作簡便，無需提取基因組DNA，適合大量細胞樣品的檢測。
· 配有陽性對照與陰性對照，保證PCR檢測結(jié)果的準確性。
TransStart? FastPfu DNA Polymerase（AP221）
一款快速PCR的熱啟動高保真DNA聚合酶，克服了普通Pfu酶擴增效率低、產(chǎn)量低和擴增速度慢的缺陷。該產(chǎn)品自上市以來備受客戶喜愛，多次榮登Nature、Nature biotechnology、Molecular cell等知名期。
產(chǎn)品特點：
· 保真性是EasyTaq? DNA Polymerase的54倍。
· 擴增產(chǎn)物為平端，可直接克隆于pEASY?-Blunt系列載體中。
· 基因組DNA片段的擴增 (≤ 15 kb)。
· Plasmid DNA片段的擴增 (≤ 20 kb)。
Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell（CD501）
一款經(jīng)特殊工藝制作的化學(xué)感受態(tài)細胞，轉(zhuǎn)化效率高達109cfu/ug DNA以上。自上市以來備受客戶喜愛，轉(zhuǎn)化效率高、產(chǎn)品性能穩(wěn)定，多次榮登Nature、Cell等知名期刊。
產(chǎn)品特點：
· 生長速度快，在氨芐青霉素平板上，8-9小時可見克隆。
· 用于藍、白斑篩選，12小時可見藍斑。
· 將過夜培養(yǎng)的單克隆在2 ml的LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)4-5小時即可進行小量質(zhì)粒提取。
· 適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴增，減少克隆DNA同源重組的發(fā)生，提高質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量。
· 具有T1, T5噬菌體抗性。
全式金產(chǎn)品再次登上Nature期刊，證明了大家對全式金產(chǎn)品品質(zhì)和服務(wù)的認可，也完美的詮釋了全式金“品質(zhì)高于一切，精品服務(wù)客戶”的理念。未來，全式金將繼續(xù)秉持“匠心”與“創(chuàng)新”，打造更多精品，助力科學(xué)研究。
使用TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit（FM311）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Modulating TRADD to restore cellular homeostasis and inhibit apoptosis[J]. Nature, 2020.
· Rapamycin pretreatment rescues the bone marrow AML cell elimination capacity of CAR-T cells[J]. Clinical Cancer Research, 2021.
使用TransStart? FastPfu DNA Polymeras（AP221）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· An engineered prime editor with enhanced editing efficiency in plants[J]. Nature Biotechnology, 2022.
· Genome-wide specificity of prime editors in plants[J]. Nature Biotechnology, 2021.
· Precise, predictable multi-nucleotide deletions in rice and wheat using APOBEC–Cas9[J]. Nature Biotechnology, 2020.
· Targeted, random mutagenesis of plant genes with dual cytosine and adenine base editors[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Prime genome editing in rice and wheat[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Rationally designed APOBEC3B cytosine base editors with improved specificity[J]. Molecular cell, 2020.
· The raphe dopamine system controls the expression of incentive memory[J]. Neuron, 2020.
· Taf14 recognizes a common motif in transcriptional machineries and facilitates their clustering by phase separation[J]. Nature communications, 2020.
使用Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell（CD501）產(chǎn)品發(fā)表的部分文章：
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins[J]. Cell, 2021.
· Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells[J]. Cell, 2020.
· A defense pathway linking plasma membrane and chloroplasts and co-opted by pathogens[J]. Cell, 2020.
· LDPE microplastics affect soil microbial communities and nitrogen cycling[J]. Science of The Total Environment, 2021.
· Consumption of miRNA-Mediated Insect-Resistant Transgenic Rice Pollen Does Not Harm Apis mellifera Adults[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021.
· Integrative Proteomic and Phosphoproteomic Analyses of Granulosa Cells During Follicular Atresia in Porcine[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2020.
· Dynamics and Regulations of BimEL Ser65 and Thr112 Phosphorylation in Porcine Granulosa Cells during Follicular Atresia[J]. Cells, 2020.
